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Research|人工光合生物工厂: 中科院化学所王树研究员课题组构建有机半导体-微生物组装系统用于太阳光驱动的化学品合成

来源:Research科学研究      2022-06-14
导读:微生物产能代谢具有丰富的多样性,如卡尔文循环和三羧酸循环,可以将可再生碳源转化为特定的化学物质,因此微生物作为生物工厂被广泛应用于化学品合成。然而,微生物代谢过程伴随着较低的生物合成效率和复杂的副产物生成。

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中国科学院化学研究所王树研究员课题组发展了一种基于可控生物合成和化学级联反应的生物组装系统,通过调控生物电子传递过程,实现非光合微生物的光合功能,并成功实现高价值化学品(苏氨酸和2-酮丁酸)的合成。相关研究工作以“Solar-Driven Producing of Value-Added Chemicals with Organic Semiconductor-Bacteria Biohybrid System”为题发表在Research上。

Citation: Wen Yu, Haotian Bai, Yue Zeng, Hao Zhao, Shengpeng Xia, Yiming Huang, Fengting Lv, Shu Wang, "Solar-Driven Producing of Value-Added Chemicals with Organic Semiconductor-Bacteria Biohybrid System", Research, vol. 2022, Article ID 9834093, 13 pages, 2022. https://doi.org/10.34133/2022/9834093

研究背景

微生物产能代谢具有丰富的多样性,如卡尔文循环和三羧酸循环,可以将可再生碳源转化为特定的化学物质,因此微生物作为生物工厂被广泛应用于化学品合成。然而,微生物代谢过程伴随着较低的生物合成效率和复杂的副产物生成。目前科学家们可通过生物和化学结合的方法来解决这些问题,例如,借助基因工程,利用基因工具修改细胞内代谢途径,创造出超越固有代谢模型的新型途径,进而提高微生物的合成精度。微生物与光电活性材料结合的人工光合生物复合系统是另一种提高微生物合成效率的方法。其中,光电活性材料在太阳光照射下产生光生电子,并定向注入微生物代谢电子传输路径,提高合成中间体的比例,最终将可再生碳源转化为高价值的化学品。

研究进展

中国科学院化学研究所王树研究员课题组成功设计并制备了具有优异电荷分离能力且能级匹配的供体-受体型(Donor-acceptor)共轭聚合物纳米粒子(D-A CPNs),利用共轭聚合物优异的光电转换性能和能级匹配的电子传递路径,在光照条件下实现光生电子向大肠杆菌(E. coli)天然代谢途径的定向注入,完成了非光合微生物的光合功能化改造,并加速了生物合成过程,使天然产物苏氨酸生产效率提高了37%;进一步通过D-A CPNs共价连接修饰的苏氨酸脱氨酶的催化转化能力,即可实现将苏氨酸进一步定向催化转化为目标增值化学品2-酮丁酸,反应转化率达53%(图1)。

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图1  大肠杆菌/D-A CPNs@Enzyme人工光合生物复合系统示意图

通过纳米沉淀方法,利用疏水性共轭聚合物(MEH-PPV和PFTP)和两亲性PSMA制备了羧基化的D-A CPNs,并对其光电性质进行测试与表征(图2)。最后,将苏氨酸脱氨酶通过氨基和羧基的缩合反应实现与D-A CPNs 的共价连接。根据光谱测试与计算,可以看出MEH-PPV的LUMO能级低于PFTP的LUMO能级,因而PFTP的光生电子可以顺利转移到MEH-PPV的LUMO能级,并抑制光生电子回落到PFTP的HOMO能级。根据MEH-PPV、PFTP及MEH-PPV/PFTP的光电流和荧光寿命测试结果,证实MEH-PPV和PFTP的组装过程有效实现了电荷分离与转移。

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图2  D-A CPNs和D-A CPNs@Enzyme的制备与表征

作者通过等温滴定量热法(ITC)和微生物表面电势(zeta potential)测量分别研究了E. coli与D-A CPNs以及D-A CPNs@Enzyme的相互作用,根据实验结果表明D-A CPNs或D-A CPNs@Enzyme与细菌结合的主要驱动力是D-A CPNs或酶表面羧基与带负电荷的大肠杆菌表面的氢键作用。同时,作者还利用扫描电子显微镜(SEM)和共聚焦激光扫描显微成像(CLSM)证明D-A CPNs和D-A CPNs@Enzyme可以很好地吸附定位在细菌表面。

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图3 D-A CPNs或D-A CPNs@Enzyme与大肠杆菌的相互作用

作者通过光照下D-A CPNs产生的光生电子实现了大肠杆菌细胞内NADPH含量的定向增强,促进了天门冬氨酸半醛脱氢酶和天门冬氨酸激酶I催化大肠杆菌内的天门冬氨酸生成苏氨酸。相对于比空白组E. coli,所构建的E .coli/D-A CPNs@Enzyme生物杂化系统在光周期为12小时的光-暗循环中累积的苏氨酸含量提高37%,合成的最终产物2-酮丁酸比对照组增加58%。生物合成效率提高主要归因于D-A CPNs在光照射下高效的空穴/电子分离过程以及电子到E .coli的高效注入。该系统的光合利用效率最高可达1.25%,媲美天然植物和藻类的光合作用效率。

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图4  E .coli/D-A CPNs@Enzyme生物杂化体系及电子转移机制研究


未来展望

通过酶修饰的有机半导体纳米粒子与微生物自组装,构建了一种基于可控生物合成和化学级联反应的人工光合生物杂化系统,实现了太阳光驱动的高价值化学品定制合成。该工作基于生物电子调控策略,不仅定向增强了生物代谢与合成过程,而且实现了非光合微生物的光合功能创制,为有机半导体的生物功能应用提供了新思路,为功能定制的生物元件进化与生物合成新途径提供了新策略。随着合成生物学技术和材料科学的快速发展,模块化的天然与非天然化学品的微生物高效合成将为我们提供一种绿色、且可持续发展的全新解决方案。

参考资料:https://mp.weixin.qq.com/s/MTBXSabPK7Tw5V5Tpjaqcg


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